Dem Ruf auf eine Professur für Klinische Infektiologie bei Lebertransplantierten an der Medizinischen Hochschule Hannover ist er im Jahr 2012 gefolgt. Sechs Jahre später wechselte er in den Schwerpunktbereich der Gastroenterologie und Hepatologie an der Universität Duisburg-Essen. Die klinischen Schwerpunkte von Professor Wedemeyer umfassen das gesamte Gebiet der Gastroenterologie und Hepatologie sowie die Infektiologie und Transplantationsmedizin.
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